Pokračovanie ságy mafiánskej rodiny nám v dvoch paralelných príbehoch spätne vyrozpráva životné osudy otca a syna Corleoneovcov, ktorých sme spoznali ako mužov zrelého veku už v prvej časti filmu Krstný otec. Malý Vito Corleone sa narodil a vyrastal na Sicílii a v roku 1910 sa prisťahoval do New Yorku. V roku 1917 už ako tínedžer prichádza Vito Corleone do newyorskej štvrte zločinu Hell’s Kitchen, kde preniká do tajov zločinného života s pomocou životných rád svojho „učiteľa“ a mizerného gangstera Clemenzu. Zároveň sledujeme aj životný príbeh jeho najmladšieho a najmilovanejšieho syna Michaela Corleoneho, ktorý spočiatku nechcel o otcových obchodoch ani počuť, ale po jeho smrti musel zastúpiť miesto hlavy rodiny a vymyslieť plán pomsty proti nepriateľskému mafiánskemu klanu, aby ochránil vlastnú rodinu. Napokon sa mu darí natoľko, že rodinný podnik Corleoneovcov rozšíri ďaleko za newyorské teritóriá – do Las Vegas, Hollywoodu a na Kubu. Michael prežije vražedný pokus, zradu rodiny aj výsluch pred trestným senátom. Cena za prežitie je však vysoká...