Populárne Ninja korytnačky sa vracejú na filmové plátno, kam ich privádza slávny akčný režisér Michael Bay a jeho produkčná spoločnosť Platinum Dunes. Muž, ktorý dokázal hračku Transformers pretaviť na jednu z najúspešnejších filmových sérií súčasnosti, má rovnaký zámer so zmutovanými korytnačími bojovníkmi. V jeho produkci majú štyria hrdinovia pomenovaní po renesančných majstroch potenciál uspieť aj u dospelejšieho publika, ako sa to podarilo práve Transformerom. Mesto New York zúfalo potrebuje hrdinov. Ovláda ho strach a všetkého schopný Shredder (William Fichtner), ktorého pozícia vládcu podsvetia je neotresiteľná, až kým sa v mestskej kanalizácii vinou nepodareného genetického experimentu neobjavia štyria obojživelníci s mimoriadnymi schopnosťami. Tam, kde sú Michelangelo, Donatello, Leonardo a Raphael nesmie pochopitelne chýbať ani zvedavá reportérka April, ktorú si zahrala Megan Fox.